(方舟子将他的新语丝学术论坛视为他攻击别人的私人领地。我在上面写了一些不同意他的话，均被删掉。因此不能不在此声明自己对他的看法。)

   这些文章渗透出唯我正确的狂傲，也散发出你的气急败坏。这几年来，你在对社会、人生和自己的认识上毫无进步。从根本上讲，你生活在自己的世界中，对别人的言论和观点一点都不能考虑。

   你爱中国吗？你真的在乎中国学术界能走上健康之路？你是科大人，也是我的校友。我知道，科大的学术环境给许多喜爱文史哲的学子很多痛苦。另一方面也不能不承认，一个纯理工科的毕业生的最大缺陷是没有对于人类文化的全面视野。很多人自以为掌握了一些数理化理论就是人才，甚至自视为天才。他们习惯于生活在自己的小圈子中，将自己无知的领域用一个标签封住以获得井底之蛙的满足。他们将宗教视为迷信，于是理所当然地无视它的存在。这是因为他们习惯于科学思维，太容易将自己客体化。他们讨论活生生的生活，也要采用冷冰冰的科学。因为他们不知道人间的苦难，更不明白自己不过是一个个体。当然，他们作为人也有自己的七情六欲，但他们从不反思自己的心理过程，只是一味地将自己心理的不满足发泄出来。

   你的文章不过是你心理的反射，更确切地讲是精神疾病的症状。你需要分析你的内心，看看你真正的需要是什么。我知道你的经历复杂，在美国有很大压力，回中国又怕人笑话自己没本事。不然，你为什么动不动就说：北大教授好当呢？也许你内心十分想当教授，却未能如愿，于是酸葡萄心理：我才不在乎呢，让我当都不当。你已经封闭了你的内心，如同一个精神病患者构造一个独立的世界不出来一样。你不是不出来，而是将你的愤怒和郁闷化作了一篇篇气急败坏的文字。就象艺术家通过艺术重新找到他们走向世界的道路一样，你企图通过文字回到众人中间。但你却不肯下苦功夫成为作家以实现你灵魂的自我拯救，更不能走出科学理性思维的牢笼，低下你高傲的脑袋，接受神的拯救。然而，科学不能拯救你的灵魂，于是你感到自己内心的骚动与不安，却不知如何是好。你那些劣制的、充满火药味的、歇斯底里的文章就是你精神疾病的症状，如同疼痛是我们肉体疾病的症状一样。因此，我给你一个建议：仔细分析自己，试着回答几个问题：我的性格为什么会是这样？回忆一下自己的童年，用纸和笔记录自己过去的创伤，告诉自己，我已经长大，不再受这些创伤的影响。这就是弗罗伊德的精神分析。

   再多的进化论知识也医治不了你内心的疾病，更多的讽刺挖苦文字也不能提高你的心灵。请不要反感“疾病”这两个字，这是科学术语。你根本不懂精神领域与科学领域的截然不同，科学的普遍性与人精神的个体性之间根本的对立。科学在你手中也失去它应有的地位，因为你早将它变成你藐视别人的资本，变成你自我感觉良好的工具。你很肤浅地企图用科学统一人类的精神世界，那你就得忍受精神病的厄运。世界上没有比人更复杂的生命了，你却坚持“还原论”的“生命不过是自然选择下的物理化学过程罢了”。你的这个科学信仰造成你今天心里没有欢乐，没有平安，也没有宽容和仁慈，只有报怨、苦毒和仇恨。康德说过最让他惊异的是头上的群星和内心的道德。因此仔细分析一下你的内心吧，这是值得的。